三条新线开通，南京地铁基本形成十字形骨架网络，南京迈入地铁网络化新时代。

南京新线有20多公里的高架线。在仙林，地铁高架从数十米的绿化带中穿过，背后是连绵的青山，构成独特的地铁风景线。

两万建设者苦战4年，总长63公里的南京地铁二号线及其东延线、一号线南延线今日通车。3条新线和已经运营5年的一号线一起，在主城形成纵贯东西、横穿南北，并向河西、仙林、江宁东山3个新市区辐射的地铁运营线路，通过珠江路地铁大厦中心的集中管理和指挥，四线并网运行，形成85公里运营网络。南京地铁进入令人振奋的新时代。

南京地铁二号线、一号线南延线、二号线东延线分别于2006年5月、2006年10月、2007年10月正式开工。总投资245亿元。

二号线东西走向，沟通了城市河西地区、主城中片和城东片区的联系，起自绕城公路油坊桥立交以南的汪家村，终点在马群。全程25.3公里，其中地下线22公里，过渡段0.5公里，地面线0.9公里，高架线1.9公里。

二号线东延线与二号线一起，构成南京市轨道交通网络东西向的重要骨干线，直接将新街口商业中心和规划的紫金山客运综合交通枢纽以及仙林大学城连接在一起。东延线起自二号线终点，下穿沪宁高速公路、宁芜铁路、百水河和黄马立交桥后钻出地面，以高架线沿仙林大道向东，止于桂山路路口东南侧的南京体育学院。全线长13.5公里，其中地下线0.9公里，地面线1.2公里，高架线11.4公里。

一号线南延线覆盖了宁南和江宁东山两大城区板块，与地铁一号线一起构成穿越南京南北方向的城市轨道交通主骨架。南延线起自一号线安德门站，由北向南，止于江宁大学城药科大学东南侧。全程24.2公里，其中地下线12.3公里，地面线0.6公里，高架线11.3公里。